Η ποιότητα της εκτύπωσης και της βιβλιοδεσίας αποτελεί σταθερή προτεραιότητα για το Ίδρυμα Ευγενίδου και συνοδεύεται από συστηματικούς ελέγχους σε όλα τα στάδια της εκδοτικής διαδικασίας.
Για πολλές δεκαετίες, η παραγωγή των βιβλίων βασιζόταν στις παραδοσιακές μεθόδους της λινοτυπίας και της μονοτυπίας, ενώ ιδιαίτερη φροντίδα δινόταν τόσο στην ποιότητα της εκτύπωσης όσο και στην αισθητική και την ανθεκτικότητα της βιβλιοδεσίας.
Με την εξέλιξη της τεχνολογίας, το Ίδρυμα πέρασε σταδιακά στην ηλεκτρονική στοιχειοθεσία και σε ένα σύγχρονο ψηφιακό περιβάλλον παραγωγής. Η στοιχειοθεσία, η διόρθωση και η σελιδοποίηση, καθώς και η επεξεργασία του εποπτικού υλικού, πραγματοποιούνται πλέον ηλεκτρονικά, μέχρι την προετοιμασία των τελικών αρχείων για εκτύπωση.
Παράλληλα, ο έλεγχος του περιεχομένου παραμένει αναπόσπαστο μέρος της διαδικασίας. Τα κείμενα περνούν από διαδοχικές διορθώσεις και, πριν από την τελική παραγωγή, ο συγγραφέας πραγματοποιεί τον τελευταίο έλεγχο και δίνει το «τυπωθήτω».
Οι τεχνολογίες και οι μέθοδοι παραγωγής άλλαξαν σημαντικά με την πάροδο του χρόνου. Σταθερή παραμένει, ωστόσο, η επιδίωξη του Ιδρύματος για άρτιες, λειτουργικές και ποιοτικές εκδόσεις.